阴茎短小目前看来，主要是由于遗传而造成的，部分人由于认识失误，会误以为自己阴茎短小，后者可以进行阴茎激活生长因子药物和心理医疗。阴茎短小的九大决定因素据性医学研究证明，阴茎的大小是与海绵体大小和膨胀结构大小决定的，造成阴茎短小，主要有九大因素：
1、为根本的是遗传基因的影响。
2、包皮过长，缺乏生长的必要空间，阻碍阴茎的发育生长。
3、后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，例如：长其从事微波、超声、高温、放射线等作业的男性，青春期前腮脉炎合并睾丸寒及长期食用粗制棉籽油等，均可以引起睾丸萎缩。
4、在母体怀孕期间因用药不当影响到雄性激素的分泌，产生先天不足，缺乏健壮性机能的营养和原素，形成先天发育不良。
5、性生活过度、身体虚弱或在青少年刚发育期间手淫过频，使肾脏在发育时无能量去壮大发育性器官，形成阴茎短小。
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